Protein–RNA interactions for Protein: P60330

Espl1, Separin, mousemouse

Predictions only

Length 2,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Espl1P60330 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Espl1P60330 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Espl1P60330 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Espl1P60330 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Espl1P60330 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Espl1P60330 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Espl1P60330 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Espl1P60330 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms