Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nphp4P59240 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms