Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms