Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd4P58467 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms