Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf16P58334 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms