Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtnsP57757 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtnsP57757 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms