Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samsn1P57725 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms