Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gsc2P56916 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms