Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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