Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bace1P56818 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Bace1P56818 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bace1P56818 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms