Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Lim2P56563 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lim2P56563 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms