Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrpP56473 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AgrpP56473 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AgrpP56473 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AgrpP56473 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AgrpP56473 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AgrpP56473 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AgrpP56473 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AgrpP56473 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AgrpP56473 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AgrpP56473 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AgrpP56473 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AgrpP56473 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AgrpP56473 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AgrpP56473 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AgrpP56473 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AgrpP56473 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AgrpP56473 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AgrpP56473 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AgrpP56473 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AgrpP56473 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AgrpP56473 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AgrpP56473 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms