Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms