Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp1P56183 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms