Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms