Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fgd1P52734 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Fgd1P52734 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fgd1P52734 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fgd1P52734 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fgd1P52734 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fgd1P52734 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fgd1P52734 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fgd1P52734 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fgd1P52734 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgd1P52734 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgd1P52734 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgd1P52734 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fgd1P52734 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgd1P52734 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fgd1P52734 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgd1P52734 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgd1P52734 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fgd1P52734 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fgd1P52734 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgd1P52734 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgd1P52734 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgd1P52734 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgd1P52734 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd1P52734 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd1P52734 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd1P52734 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd1P52734 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd1P52734 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd1P52734 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd1P52734 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd1P52734 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fgd1P52734 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd1P52734 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fgd1P52734 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd1P52734 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd1P52734 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd1P52734 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd1P52734 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd1P52734 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd1P52734 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd1P52734 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd1P52734 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms