Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Upp1P52624 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp1P52624 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms