Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms