Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc4P51655 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms