Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TspoP50637 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TspoP50637 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TspoP50637 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TspoP50637 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TspoP50637 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TspoP50637 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TspoP50637 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TspoP50637 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TspoP50637 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TspoP50637 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TspoP50637 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TspoP50637 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TspoP50637 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TspoP50637 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TspoP50637 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TspoP50637 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TspoP50637 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TspoP50637 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TspoP50637 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TspoP50637 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TspoP50637 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TspoP50637 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TspoP50637 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TspoP50637 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TspoP50637 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TspoP50637 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TspoP50637 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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TspoP50637 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TspoP50637 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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