Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FmodP50608 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FmodP50608 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FmodP50608 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FmodP50608 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FmodP50608 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FmodP50608 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FmodP50608 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FmodP50608 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FmodP50608 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FmodP50608 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FmodP50608 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FmodP50608 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms