Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpbP50405 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms