Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BckdhaP50136 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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