Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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