Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms