Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CitP49025 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CitP49025 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CitP49025 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CitP49025 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CitP49025 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CitP49025 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CitP49025 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CitP49025 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CitP49025 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CitP49025 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CitP49025 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CitP49025 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CitP49025 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CitP49025 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CitP49025 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CitP49025 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CitP49025 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CitP49025 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CitP49025 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CitP49025 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CitP49025 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CitP49025 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CitP49025 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CitP49025 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CitP49025 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CitP49025 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CitP49025 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CitP49025 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CitP49025 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CitP49025 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CitP49025 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CitP49025 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CitP49025 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CitP49025 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CitP49025 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CitP49025 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms