Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GdnfP48540 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GdnfP48540 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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