Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prox1P48437 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms