Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox2P48432 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox2P48432 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms