Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms