Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms