Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrprbP47758 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrprbP47758 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms