Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax7P47239 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms