Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stt3aP46978 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms