Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx1P43345 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms