Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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