Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VhlP40338 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VhlP40338 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms