Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ThpoP40226 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ThpoP40226 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms