Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms