Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik2P39087 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms