Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtlP38585 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtlP38585 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtlP38585 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TtlP38585 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtlP38585 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TtlP38585 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtlP38585 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtlP38585 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtlP38585 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtlP38585 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtlP38585 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TtlP38585 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TtlP38585 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TtlP38585 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TtlP38585 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TtlP38585 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtlP38585 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms