Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sar1aP36536 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms