Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KdrP35918 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KdrP35918 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KdrP35918 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KdrP35918 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KdrP35918 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KdrP35918 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KdrP35918 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KdrP35918 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KdrP35918 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KdrP35918 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KdrP35918 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdrP35918 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KdrP35918 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KdrP35918 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdrP35918 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdrP35918 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KdrP35918 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KdrP35918 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KdrP35918 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KdrP35918 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KdrP35918 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KdrP35918 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KdrP35918 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KdrP35918 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KdrP35918 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KdrP35918 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KdrP35918 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KdrP35918 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KdrP35918 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KdrP35918 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KdrP35918 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KdrP35918 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KdrP35918 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KdrP35918 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KdrP35918 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms