Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rab5cP35278 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5cP35278 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rab5cP35278 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rab5cP35278 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rab5cP35278 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rab5cP35278 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rab5cP35278 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rab5cP35278 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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