Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pola2P33611 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms