Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cd28P31041 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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