Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tacr1P30548 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms