Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms