Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif5cP28738 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms