Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa2P28309 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa2P28309 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms